dchip. Análise de microarrays de expressão gênica facilitada.
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dchip. Descrição

O DCIP é uma aplicação útil especialmente projetada para níveis de sonda como a plataforma Affymetrix e análise de alto nível de microarrays de expressão gênica e microarrays SNP. Expressão gênica ou dados SNP de várias plataformas de microarray também podem ser analisadas importando como conjunto de dados externo. No nível da sonda, o DCIP pode exibir e normalizar os arquivos CEL, e a abordagem baseada em modelos permite reunir informações em várias matrizes e seleção automática de sonda para lidar com a contaminação cruzada e a contaminação de imagem. A análise de alto nível no DCIP inclui comparar amostras, agrupamento hierárquico, exibição de dados de expressão e SNP ao longo da análise de cromossômicos, loh e número de cópia de matrizes SNP e análise de ligações. Nestas funções, as informações do gene e as informações da amostra estão correlacionadas com os resultados da análise.

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