VMD molecular VMD é um programa de visualização molecular para exibir, animar e muito mais.
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VMD molecular Classificação e resumo

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VMD molecular Descrição

O VMD é projetado para a visualização e análise de sistemas biológicos, como proteínas, ácidos nucleicos, conjuntos de bilayer lipídicos, etc. Pode ser usado para ver mais moléculas gerais, já que a VMD pode ler Arquivos de banco de dados de proteína padrão (PDB) e exibir a estrutura contida. A VMD fornece uma ampla variedade de métodos para renderização e molécula de coloração. O VMD pode ser usado para animar e analisar a trajetória das simulações da dinâmica molecular (MD) e pode manipular interativamente as moléculas sendo simuladas em computadores remotos (MD interactivo). Principais características do VMD incluem: Suporte para todas as principais plataformas de computador Suporte para processadores multicore Suporte para computação acelerada GPU Muitos excelentes tutoriais VMD desenvolvidos localmente, e pela comunidade de pesquisa em geral Não há limites sobre o número de moléculas, átomos, resíduos ou número de quadros de trajetória, exceto a memória disponível Muitas renderização molecular e métodos para colorir Capacidade de exibição estéreo Sintaxe extensa de seleção de átomo para escolher subconjuntos de átomos para exibição (inclui operadores booleanos, expressões regulares e mais) Suporte para mais de 60 formatos de arquivos moleculares e tipos de dados por meio de uma extensa biblioteca de plugins de arquivo / gravador de arquivos integrados e tradutores O VMD inclui um plugin de alinhamento de múltiplas sequências, um ambiente de análise BioInformatics unificado que permite organizar, exibir e analisar os dados de seqüência e estrutura para proteínas e ácidos nucleicos. Capacidade de exportar gráficos exibidos para arquivos que podem ser processados por um número de rastreamento de raios populares e pacotes de renderização de imagem, incluindo pov-ray, rayshade, raster3d e tachyon. Interfaces de usuário gráficas e de texto extensíveis pelo usuário, TCL padrão interno / TK e idiomas de scripts Python Extensões para a linguagem TCL que permitem aos pesquisadores escrever suas próprias rotinas para análise molecular

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