Tripleto Um programa para construir árvores consensuais a partir de triplos enraizados
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Tripleto Classificação e resumo

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Tripleto Descrição

Triplec foi desenvolvido para ser um programa para construir árvores consensuais a partir de triplos enraizados. Uso java -jar triplec.jar neeps infile.newick Aqui Noreps é o número de reconstruções triplas para usar para o consenso. Isso é necessário porque a reconstrução é um algoritmo randomizado. Para pequenas árvores de cerca de 20 táxons 1000 repetições é suficiente. Mas números maiores devem ser usados para conjuntos de dados maiores. Infile.Newick é um arquivo de texto com uma árvore de recém-nascida por linha. As árvores são consideradas enraizadas e cada árvore deve conter apenas os rótulos da primeira árvore. Isso é árvores depois que o primeiro não deve conter novos taxas. Embora não seja um erro ter árvores com menos taxa do que a primeira árvore como parte do consenso, esse método não é um método super-árvore. O desempenho sob estas condições não foi testado e esperamos que isso funcione mal.

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