Transposponsi. Uma ferramenta de análise para identificar proteína ou homologia de sequência de ácido nucleico
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Transposponsi. Classificação e resumo

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Transposponsi. Descrição

Editar por Transposonpsi é uma ferramenta de análise para identificar proteína ou sequência de ácido nucleico homology para proteínas codificadas por diversas famílias de elementos transponíveis. O PSI-BLAST é usado com uma coleção de perfis de homologia ORF (retro-) transposon para identificar alinhamentos estatisticamente significativos. Este método pode ser usado para identificar potenciais transposon orfs dentro de um conjunto de proteínas, ou para identificar regiões de homologia transposon dentro de uma sequência maior genoma. Isso é particularmente útil para identificar homologias degeneradas transposon dentro de seqüências genômicas que escapam de identificação e mascaramento usando RepingMasker e uma biblioteca nucleotídica associada de elementos repetitivos. Transposponsi foi usado rotineiramente no Instituto de Pesquisa Genômica para auxiliar na descoberta de elementos móveis entre os eucariotos, incluindo protozoários, plantas, fungos e animais.

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