Tempo normalizado de eluição (líquido) Utilitário de previsão Compute previu valores de tempo de eluição normalizados para sequências peptídicas
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Tempo normalizado de eluição (líquido) Utilitário de previsão Classificação e resumo

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Tempo normalizado de eluição (líquido) Utilitário de previsão Descrição

O utilitário de previsão normalizado de eluição (líquido) é um pequeno utilitário projetado para calcular os valores de tempo de eluição normalizados previstos (líquidos) para uma lista de seqüências peptídicas. Os tempos de eluição são destinados a serem utilizados com cromatografia líquida de fase invertida (por exemplo, usando as análises de partículas de sílica revestida C18), e são usadas em nosso laboratório para alinhamento de conjuntos de dados LC-MS e LC-MS / MS entre si (usando os tempos de eluição previstos para formar um conjunto de dados do Mestre In-Silico para alinhar cada conjunto de dados para). Os tempos de eluição previstos também são usados pelo simulador de digestão de proteína básico ao calcular o número de péptidos identificáveis exclusivamente dentro de um arquivo de entrada usando a massa e a rede. O utilitário de previsão líquido lê os peptídeos de um arquivo de texto contendo uma sequência peptídica em cada linha. O arquivo de saída inclui a sequência peptídica mais o valor líquido previsto (e / ou o valor SCX previsto) usando um ou todos os algoritmos de previsão: · Modelo de tempo de retenção de Kangas / Petrite LC · Modelo de fração de Kangas / Petrite SCX · Modelo de hidrofobicidade de Krokhin · Modelo de hidrofobicidade

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