Tarzan. Compute qualquer reconstrução mais barata
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Tarzan. Classificação e resumo

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Tarzan. Descrição

O aplicativo Tarzan usa um método baseado em eventos que permite que os usuários encontrem custos mínimos ou reconstruções ou reconstruções que tenham um número mínimo (ou máximo) de certos eventos evolucionários. Cinco tipos diferentes de eventos evolutivos são considerados: Cospeciação, duplicação, classificação, troca e extinção. Para sistemas de parasita hospedeiros Cospeciation Events referem-se à especiação simultânea do host e do parasita, os eventos de duplicação são especiais de parasitas independentes, os eventos de classificação correspondem à classificação de linhagem e os interruptores correspondem aos turnos de hospedagem. Principais características: Tarzan oferece não apenas a possibilidade de calcular qualquer reconstrução mais barata, mas também pode calcular a reconstrução que são calculadas para outros critérios. Além disso, uma hierarquia de critérios pode ser definida (nesse caso a otimização é feita primeiro em relação ao critério mais importante, então, dentro de todas as opções de soluções Optimais encontradas, é feita com relação ao segundo maior critério e assim por diante. Critérios possíveis são (em Cada caso é mínimo ou máximo é possível): Custo, número de cospecias, número de dupliciações, número de triagens, número de interruptores de host, número de extensões O número máximo de reconstruções mais baratas que são computadas por Tarzan podem ser definidas pelo usuário. Tarzan também pode listar todas as possíveis reconstruções que podem ser interessantes para os casos em que não existem muitas reconstruções.

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