Técnica SVM para avaliar peptídeos proteóticos Stepp é uma ferramenta de peptídeos proteotípicos avaliando.
Baixe Agora

Técnica SVM para avaliar peptídeos proteóticos Classificação e resumo

Técnica SVM para avaliar peptídeos proteóticos Tag

disjuntor senha Técnica de guitarra celular grátis Software de TV para Software antivírus móvel lix.in forum ls. LG GT540 Optimus Previsão de SVM SVR. Técnica de liberação Projeto de técnica Delphi. Avaliando RFP. Técnica de desenho livre vox s

Técnica SVM para avaliar peptídeos proteóticos Descrição

O software Stepp contém uma implementação de um SVM treinado (suporte de vetor de suporte) que pode calcular uma pontuação representando como "proteotípico" um peptídeo é por LC-MS. O programa pode ler um arquivo de proteína, realizar uma digestão no silico e calcular a pontuação de observação para cada peptídeo tríptico ou parcialmente tritípico. Observe que as pontuações maiores (positivas) significam que um peptídeo é previsto para ser mais proteotípico enquanto os escores inferiores (negativos) significam que o péptido não é previsto para ser proteotípico. O modelo SVM usado pela Stepp é um espaço de descritor simples com base em 35 propriedades de conteúdo de aminoácidos, carga, hidrofilicidade e polaridade para a previsão quantitativa de péptidos proteotípicos. O modelo foi treinado e validado com três bancos de dados Amt derivados independentemente (Shewanella Oneidensis, Salmonella Typhimurium, Yersinia Pestis). O SVM resultou em uma medida média de precisão de 0,8 com um desvio padrão inferior a 0,025.

Técnica SVM para avaliar peptídeos proteóticos Software Relacionado