Simulador de deslocamento de DNA Strand Um simulador de linha de comando para circuitos de DNA
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Simulador de deslocamento de DNA Strand Classificação e resumo

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Simulador de deslocamento de DNA Strand Descrição

Recentemente, uma gama de circuitos de processamento de informações foram implementados no DNA usando o deslocamento de Strand como seu principal mecanismo computacional. Exemplos incluem circuitos lógicos digitais e circuitos de amplificação de sinal catalíticos que funcionam como detectores moleculares eficientes. À medida que novos paradigmas para o cálculo de DNA surgem, o desenvolvimento de idiomas e ferramentas correspondentes para esses paradigmas ajudará a facilitar o desenho de circuitos de DNA e sua compilação às sequências nucleotídicas. Apresentamos uma linguagem de programação para projetar e simular circuitos de DNA no qual o deslocamento de Strand é o principal mecanismo computacional. A linguagem inclui elementos básicos de domínios de sequência, toeholds e migração de ramificação, e assume que os fios não possuem qualquer estrutura secundária. O idioma é usado para modelar e simular uma variedade de circuitos, incluindo um portão catalítico acionado por entropia, um simples motivo de portão para sintetizar circuitos de grande escala e um esquema para implementar um sistema arbitrário de reações químicas. A linguagem é um primeiro passo para o projeto de modelagem e ferramentas de simulação para o deslocamento de DNA Strand, que complementa o surgimento de novas estratégias de implementação para computação de DNA. O aplicativo de Simulador de Deslocamento do DNA Strand foi desenvolvido para ser um simulador de linha de comando para circuitos de DNA.

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