Simprot é uma ferramenta acessível e fácil de usar especialmente projetada para ajudá-lo a simular a evolução da proteína por substituição, inserção e exclusão. A evolução da proteína foi amplamente modelada considerando a substituição de aminoácidos processo; No entanto, eles têm sido poucos estudos sobre o processo de inserção e exclusão. O SimProt permite vários modelos de substituição de aminoácidos (PAM, JTT e PMB), permite taxas de sites distribuídos gama de acordo com o modelo de Yang, e implementa um modelo de distribuição de Qian e Goldstein parametrizado para inserção e exclusão.
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