SEQ monk.

Seqmonk é um programa para permitir a visualização e análise de dados de sequência mapeada. Foi escrito para uso com dados mapeados de sequência de próxima geração, mas pode em teoria ser usado para qualquer conjunto de dados que
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SEQ monk. Classificação e resumo

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  • Rating:
  • Licença:
  • GPL
  • Nome do editor:
  • Babraham Bioinformatics
  • Site do editor:
  • http://www.bioinformatics.bbsrc.ac.uk
  • Sistemas operacionais:
  • Windows All
  • Tamanho do arquivo:
  • 2.1 MB

SEQ monk. Tag


SEQ monk. Descrição

Uma ferramenta para visualizar e analisar dados de sequência mapeados de alta taxa de transferência SEQMONK é um programa para habilitar a visualização e análise de dados de sequência mapeada. Foi escrito para uso com os dados mapeados de sequência de próxima geração, mas podem ser usados em teoria para qualquer conjunto de dados que possa ser expresso como uma série de posições genômicas. São principais recursos são: * Importação de dados mapeados de dados mapeados (BAM / SAM / Bowtie / MAQ etc) * Criação de grupos de dados para visualização e análise * Visualização de regiões mapeadas contra um genoma anotado. * Quantização flexível dos dados mapeados para permitir comparações entre os conjuntos de dados * Análise estatística de dados para encontrar regiões de interesse * Criação de relatórios contendo dados e anotação do genoma


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