Robin Um simples de usar o pré-processador de dados de microarray que suporta todas as plataformas comuns de microarray
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Robin Descrição

Atualmente, vários programas comerciais, como genespring, apresentam uma interface de usuário rica e simples para analisar estatisticamente os microarrays estão disponíveis. No entanto, estes são geralmente muito caros e podem até exigir uma assinatura anual Por outro lado, há ferramentas de código aberto gratuitas, como biocondutor que oferecem grandes opções estatísticas e suporte gratuitamente, mas essa potência geralmente vem ao preço da usabilidade, uma vez que essas ferramentas geralmente apresentam apenas uma interface de linha de comando ou somente Interação básica do usuário. Finalmente, existem ferramentas como RMA Express que oferecem uma interface de usuário rica, mas apenas um conjunto de opções muito limitadas. Robin tenta preencher essa lacuna, fornecendo uma interface gráfica flexível amigável para liberar o poder de R / Biocondutor para o biólogo individual. Robin vem como um arquivo instalável, que também instala as estruturas R e Biocondutor. Atualmente, o uso de Robin é possível normalizar dados da Affymetrix e tabular genéricos de duas cores ou dados de matriz único usando uma gama de diferentes métodos de normalização. Além disso, Robin oferece uma variedade de métodos de controle de qualidade que podem ser usados para obter uma visão geral da qualidade e estrutura técnica de dados experimentais. Usando o designer de experimentos gráficos embutidos, os pesquisadores podem definir quais amostras compararem (mesmo combinações de amostras são possíveis) e, finalmente, produzir um conjunto abrangente de tabelas e parcelas, dando resultados detalhados do experimento, como a mudança de log (m), valores médios de expressão (a) a uma probabilidade (user-ajustável) para expressão diferencial. Tabelas resumindo informações sobre os 100 primeiros genes regulamentados diferenciados e várias parcelas que visualizam a qualidade de cada chip também são geradas. Os resultados podem ser importados diretamente para o Mapman e Pageman para visualização e análise posterior. Robin traz para você uma solução completa para análise de microarray e processamento de dados.

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