Rnashapes. Uma heurística de tempo de execução para acelerar o cálculo de probabilidades de forma acumulada
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Rnashapes. Classificação e resumo

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Rnashapes. Descrição

Rapidshapes foi desenvolvido para ser uma heurística de tempo de execução para acelerar o cálculo de probabilidades de forma acumulada. A abstração de forma de RNA mapeia estruturas para um domínio da árvore de formas, retenção de adjacência e aninhamento de características estruturais, mas desconsiderando os comprimentos de hélice. A abstração de forma integra bem os algoritmos de programação dinâmica e, portanto, pode ser aplicado durante a previsão da estrutura, em vez de depois. Isso evita a explosão exponencial e ainda pode nos dar uma conta não heurística e completa de propriedades do espaço dobrável da molécula. Rnashapes oferece três poderosas ferramentas de análise de RNA em um único pacote de software: - Computação de um pequeno conjunto de estruturas representativas de diferentes formas, completa em um sentido bem definido. - Computação de probabilidades de forma acumulada. - Previsão comparativa de estruturas de consenso, como alternativa ao algoritmo sankoff excessivo.

Rnashapes. Software Relacionado