O RNA-DV é uma aplicação fácil de usar, útil que visa fornecer uma GUI fácil de usar para visualizar e projetar estruturas secundárias de RNA. Ele permite que os usuários interajam diretamente com a estrutura do RNA e execute operações, como alterar o conteúdo da seqüência principal e conectar / desconectar ligações nucleotídeos. Também integra cálculos de energia termodinâmica, incluindo quatro grandes modelos de energia. O RNA-DV reconhece três formatos de entrada, incluindo CT, RNAML e suporte de ponto (DP).
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