Proteqfetch

Download sequências de proteína com facilidade.
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Proteqfetch Classificação e resumo

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  • Rating:
  • Licença:
  • GPL
  • Nome do editor:
  • pauleym
  • Sistemas operacionais:
  • Windows All
  • Tamanho do arquivo:
  • 263 KB

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Proteqfetch Descrição

O ProtseqFetch é um pequeno aplicativo baseado em Java, especialmente projetado para ajudá-lo a baixar seqüências de proteína do banco de dados NCBI ou NR. Este software oferece essas ferramentas: Download Dados da Sequência: Duas opções são fornecidas para baixar dados de sequência de NCBI ou arquivo NR local. Carregando lista de organismos: Duas opções são fornecidas ao usuário para fazer upload da lista de organismos. Um é através do teclado, entrando no organismo em um campo de texto. A segunda maneira é selecionando um arquivo contendo lista de organismos. As seqüências são baixadas para o arquivo nrosquencyi.fa no diretório de downloads. Se alguma sequência redundante fosse encontrada, eles serão salvos no arquivo redesseções.fa. Baixe o banco de dados do NR: Esta função fornece ao usuário para baixar o banco de dados NR de NCBI para o sistema local. Existem 4 partes total de NR.00 para NR.03 disponíveis para download. O usuário precisa digitar qual parte para download (de 0 a 3). Cada arquivo é de cerca de 800 MB de tamanho. e pode levar várias horas para download com base na sua velocidade da Internet. Verifique o organismo: Este utilitário pode ser usado para verificar a exatidão do nome do organismo dado, conectando-se a NCBI e validando.


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