Peakfinder. localiza picos (coesin sites de ligação) em dados de microarry de chip de levedura
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Peakfinder. Classificação e resumo

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inventor localizador Alter vinculação de protocolo mostra ligação de protocolo ligação de protocolo pico Selecione a vinculação Ligação de esqui implementar obrigatório Encadernação Renderman Mecanismo de ligação flexível ligação de dados vinculativo C ++ para Lua Binding criar vinculação gerar vinculação Biblioteca de ligação Qt 4 ligação ligação .NET conjunto de ligação Twin Peaks Screensaver Twin picos OpenCl API Binding. Ligação QT. ligação python Localizar pico encontrar pico localizador de pico Veja os picos cromatográficos Análise de picos cromatográficos. Ligação da API de Banco de Dados tri picos ja. texto criador de mosaico Gota ácida 1.0. Cortador de ringtone N73. Baixe Tor Navegador usb remover com segurança Adobe Acrobat5 Serial. Nero Plugin Lame. escritor php Extrator de arquivo nrg. Loja de corpo sims3pack. Driver Ethernet Universal. driver bluetooth ivt

Peakfinder. Descrição

O aplicativo WeepFinder foi desenvolvido para ser uma ferramenta que localiza picos (coesin liga-se sites) em dados microarry de chip (imunoprecipitação de cromatina). A Peakfinder é uma ferramenta de visualização do genoma que pesquisa dados de taxa de microarray para "picos". Os picos são encontrados usando uma curva suavizada que pode ser escolhida de forma interativa. O conteúdo do nucleotídeo usando uma janela móvel especificada pode ser exibido junto com os resultados do microarray. O programa é quase genérico para qualquer genoma, mas ainda tem alguns parâmetros apenas de levedura. Arquivos de entrada: - GenomeIndex.dat File: Coordenadas Diga a localização de cada cromossomo dentro do genoma. A localização Centromere também é especificada. - "Coordenadas de recurso" Planilha do Excel: Colunas A, B e C devem ser nome, coordenada, coordenada2. As coordenadas são coordenadas de genoma para cada recurso. - Planilha do Excel "Ratia" com dados de microarray: coluna A deve ser "iname". Os dados da proporção são assumidos como na última coluna. O recurso "iname" valores deve mach aqueles especificados na planilha de coordenadas de recursos. - Diretório com sequências nucleotídicas, um arquivo para cada cromossomo. Os dados da sequência podem estar no formato FASTA com um defletor ou simplesmente um arquivo ASCII. Os nomes dos arquivos devem ser Chr * ou Chrnn *. Por exemplo, chr05.fsa, ou chrviiii_562639.ascii. Qualquer formato de arquivo "velho" ou "novo" do banco de dados do Genoma Saccharomyces é aceitável. - Peakfinder.ini está no diretório C: \ documentos e configurações \ Configurações locais \ Data do aplicativo \ StowersInstitute \ Peaighfinder Arquivos de saída: - O gráfico é colocado automaticamente na área de transferência, se a opção Bitmap ou Metafile for selecionada e pode ser imediatamente colada em qualquer outro aplicativo depois de ser exibido. (Desmarque a caixa de gráfico de salvamento automático pára dessa colocação automática do gráfico na área de transferência). Caso contrário, pressione o botão Salvar na tabela do gráfico para salvar o gráfico para um arquivo GIF especificado. - O botão Salvar picos no tabuleiro de picos pode ser selecionado para salvar um arquivo peaks.csv, que pode ser aberto no Excel. - O botão "Processar All" no Tablet Rawdata resulta em um conjunto de arquivos que estão sendo produzidos. Normalmente, especifique um novo diretório e ele conterá esses arquivos quando o processamento estiver concluído: ratiofilename.dat, ratiofilename-cromossomenno.gif (NN = 01 a 16) e ratiofilename-picos.csv, onde o ratiofilename é o nome da proporção excel Arquivo especificado na planilha de dados brutos.

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