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  • Rating:
  • Licença:
  • GPL
  • Nome do editor:
  • Gregory Grant & Junmin Liu
  • Sistemas operacionais:
  • Windows All
  • Tamanho do arquivo:
  • 3.5 MB

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Página Descrição

A página é uma aplicação fácil de usar especialmente projetada para ajudá-lo com a análise de micro-array. A página pode ser usada para produzir conjuntos de genes diferencialmente expressos com medidas de confiança anexadas. Essas listas são geradas o método falso da taxa de descoberta de controlar os falsos positivos. Mas a página é mais do que uma ferramenta de análise de expressão diferencial. A página é uma ferramenta para anexar padrões de expressão descritivos, confiáveis e facilmente interpretáveis a genes em várias condições, cada um representado por um conjunto de experimentos de matriz replicados. A entrada consiste em intensidades (replicadas) de uma coleção de experimentos de matriz de duas ou mais condições (ou de uma coleção de comparações diretas em matrizes de 2 canais). A saída consiste em padrões, um para cada identificador de linha no arquivo de dados. Uma condição é usada como referência a que os outros tipos são comparados. O comprimento de um padrão é igual ao número de tipos de amostra de não referência. Os símbolos nos padrões são inteiros, onde inteiros positivos representam a regulação em comparação com o tipo de amostra de referência e os inteiros negativos representam a regulação. Os padrões são baseados nas taxas de descoberta falsas para cada posição no padrão, para que o número de símbolos positivos e negativos que apareçam em cada posição do padrão seja tão descritivo quanto a variabilidade de dados permite. Os padrões gerados são facilmente interpretáveis nesses inteiros são usados para representar diferentes níveis de regulação para cima ou para baixo em comparação com o tipo de amostra de referência.


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