Opsm Miner. guia delimitado ASCII
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Opsm Miner. Classificação e resumo

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Opsm Miner. Descrição

Este pacote fornece um projeto opsm miner e informações. entrada - Guia delimitou o arquivo ASCII. Linhas são tecidos, colunas são expressões genéticas. Uma linha pode conter uma coluna de cabeçalho e sua pode ser uma linha de cabeçalho. Em qualquer caso, o número de colunas deve ser igual a todas as linhas. - Uma linha de cabeçalho e coluna podem conter qualquer string, todos os outros valores devem conter números. - O tamanho da matriz é t (tecidos) x g (expressões gênicas). algoritmos e bandeiras O algoritmo está realizando a comparação vertical DFS, que significa duas expressões genéticas são comparadas. - "Usar no Core Dual Compare" - Pré-construir todos os pares de expressões vetores, isso levaria o tamanho do GXGXT na memória, portanto, certifique-se de que ele possa caber a memória. - "Suporte" - o número de tecidos que contém um padrão. Defina o suporte ao aplicativo para este número mínimo de tecidos que você deseja conter o padrão que você está procurando. Definir um número muito alto renderá muito poucos padrões, número muito baixo - e a mineração pode não terminar (número exponencial de padrões). - "Min Comprimento", "Max Comprimento" - o tamanho dos padrões que você está procurando. Definir "Min Comprimento" para que o aplicativo não retorne padrões muito curtos e não interessantes. Defina "Comprimento máximo" para reduzir o tempo de execução. - "Max Erros" - apenas para opsm com erros. OPSM procura padrões exatos. OPSM com erros contam um tecido, mesmo que contenha um número X de genes que não se encaixam no padrão. - "Max Group Len" - para OPSM com grupos, o padrão é comparado entre grupos de genes em vez de genes únicos. Por exemplo, o padrão será: (0,40,60,4) (0,70,8) (0,90,95) - "Max Layer Diff" - Não lembre ... Como utilizado OPSM com algoritmo de camadas Ao configurar camadas, deve haver um arquivo de definição de camadas com o mesmo nome do arquivo de conjunto de dados, anexado com ".Layers". Por exemplo: Saltdat.txt. Saltdat.txt.layers. Formato de arquivo - Cada linha representa uma camada. Cada camada é uma variedade de colunas: 0-5. 6-10. ... ...

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