Openastexviewer. Um programa de gráficos moleculares java que auxilia na estrutura baseada em design de drogas
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Openastexviewer. Classificação e resumo

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Openastexviewer. Descrição

O openastexviewer foi desenvolvido para ser um programa de gráficos moleculares java que auxilia na estrutura baseada em design de drogas. Pode ser usado como applet em uma página da Web ou como um aplicativo de desktop. O software deve ser executado na maioria dos sistemas operacionais e na maioria dos navegadores da Internet. O openastexviewer fornece suporte para estender a linguagem de script com comandos arbitrários. Este documento cobre um exemplo disso. Se a parte do comando de um comando de script não for reconhecida, um arquivo de classe desse nome é procurar. Se isso for encontrado, uma instância é criada usando a reflexão, e o método estático Handlecommand é chamado com uma referência ao moleculeviewer, o moleculerenderer e a lista de argumentos. O comando pode fazer coisas bastante complicadas. O exemplo abaixo cria uma instância de si, que é uma subclasse de GraphicalObject. Isso inicia um tópico que animará o renderizador. O objeto passa pelos átomos que foram transmitidos como parte do comando, e desenha uma esfera verde, por sua vez, na posição de cada átomo. O comando seria usado algo como Animado -Name Calpha -atoms {Atom CA}; Principais características: Esfera, cilindro e estilos de exibição de varas para moléculas. rotulagem versátil e monitores de distância. Superfícies moleculares sombreadas, com transparência e mapeamento de propriedade. Esquema de Proteína e Atribuição de Estrutura Secundária. Produção de imagem de alta qualidade para resolução arbitrária, com antialiasing e sombras.

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