Ontomine Ontomine é um software de mineração de dados usado para mineração molecular automatizada para bioatividade, toxicidade e previsão de efeito colateral. Ontomine é baseado em propriedades experimentalmente determinadas de cerca de 100.0
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Ontomine Classificação e resumo

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Ontomine Descrição

Um software de mineração de dados usado para mineração molecular automatizada para bioatividade Ontomine é um software de mineração de dados usado para mineração molecular automatizada para bioatividade, toxicidade e previsão de efeito colateral. A ontomina é baseada em propriedades experimentalmente determinadas de cerca de 100.000 diversas pequenas moléculas, coletadas de bancos de dados, enciclopédias e outra literatura seguida de curadoria especializada. Este conjunto de dados é formulado em árvores hierárquicas compostas por vários milhares de classes de bioatividades, alvos de drogas, áreas terapêuticas, efeitos adversos e toxicidades. Cada classe é representada por uma impressão digital para as moléculas relacionadas para suas propriedades moleculares, como presença / ausência / contagens de cadeias laterais / atividades químicas, estruturas de anel etc. Ontomine e comparação com outros métodos existentes Outras abordagens de predição de bioactividade atualmente usadas podem ser classificadas em três categorias: * Gráfico teorético e subestrutura, descritores químicos topológicos e físico-químicos * Subestruturas comuns máximas, impressões digitais semelhanças e métodos de aprendizagem de máquina * Métodos de vizinhança do átomo No entanto, estes métodos estão atualmente limitados por fatores como a dependência das métricas de distância, as cortinas não são representativas de atividade, difíceis de construir modelos QSAR em vários níveis diferentes, e. Alvos de drogas, Bio processos e área terapêutica, bem como interpretação dos resultados. Ontomine (Patenteado dos EUA) é alternativa a esses métodos, transformando as informações estruturais para moléculas quimicamente, biologicamente ou farmacologicamente relacionadas a um esquema hierárquico de conceitos e descritores. Ontomine descobre padrões no esquema relacionado e prevê a atividade biológica, usando regras inferidas de analisar os padrões. Uma vantagem significativa dos algoritmos de ontomina é que permitem que o andaime pulando, já que o núcleo do andaime não é conservado quando os padrões característicos de uma atividade são descobertos. Os padrões de ontomina representam condições "necessárias, mas não suficientes" para a bioatividade, independentemente de um andaime. O salto explícito de andaimes pode ser realizado gerando isômeros constitucionais e selecionando moléculas interessantes usando a base de regras. Os resultados da ontomina são apresentados como padrões simples, representativos da atividade. Além disso, as previsões ontominas são escaláveis para milhões de moléculas. Além disso, os conjuntos de dados de ontomina curados podem ser anexados com conjuntos de dados internos de atividades de moléculas medidas de coleções de compostos internos.

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