Nemo. Estude a história dos conjuntos fenotípicos
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Nemo. Classificação e resumo

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Nemo. Descrição

A NEMO é um software de simulação de formação avançado, geneticamente explícito, baseado em indivíduos e estocásticos especialmente construídos para estudar a evolução da história da vida / características fenotípicas e genética populacional em um quadro populacional flexível (meta-). A Nemo implementa muitos eventos de ciclo de vida e traços evoluídos com uma variedade de arquiteturas genéticas. A interação de espécies entre um parasita e seu hospedeiro também podem ser modeladas (isto é, incompatibilidade citoplasmática, induzindo endossymbiont: Wolbachia). Tudo isso é enquadrado dentro de um modelo de metapopulação flexível que permite capacidades de transporte específicas de patch, taxas de dispersão, extinção estocástica / taxas de colheita e estocasticidade demográfica. As populações podem ser modificadas dinamicamente durante uma simulação, permitindo que os gargalos populacionais, a fusão de patch / fissão, expansão populacional, etc. Seleção espacialmente heterogênea em traços quantitativos também possam ser modeladas. Principais características: traços: marcadores neutros (microssatélites, SNPS) mutações deletérias (com efeitos fixos ou aleatórios específicos de locus e dominância) traços quantitativos (novo em v2.2.0) (com loci quantitativo pleiotrópico) Dispersal (expressão masculina e feminina específica) Wolbachia (maternamente herdada citoplasmic-incompatibilidade induzindo endosimbiont) eventos de ciclo de vida: Criação (com promiscuidade, poliginy, monogamia, selfing e clonagem de sistemas de acasalamento) Se dispersar (Migrante Piscina / Propagule Modelo da Ilha de Piscina, Modelos de Treliça 1D e 2D, etc.) Envelhecimento (com regulação de patch de teto) Seleção de viabilidade (com base em mutações deletérias ou seleção de estabilização em traços quantitativos) extinção / colheita Fusão de remendo / fissão Crossing Design (Projetos Full-Sib / Half-Sib)

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