Multigeneblast

Identifique homólogo de módulos multi-gene, como operões e clusters genéticos.
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Multigeneblast Classificação e resumo

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  • GPL
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  • Nome do editor:
  • By MultiGeneBlast
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  • Windows 2003, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP
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Multigeneblast Descrição

Multigenegeblast é uma ferramenta de código aberto com base em uma reformatação dos cabeçalhos FASTA de entradas de proteína do NCBI Genbank, usando o que pode rastrear seu nucleotídeo de origem e coordenadas. Multigenegeblasto pode ajudar na detecção de tais partes multigéne para projetos de biologia sintética. Uma biblioteca sintética de operões pode ser criada com base em sua saída para identificar essas operões cuja função é mais próxima da desejada pelo usuário. Essa ferramenta fornece as oportunidades para identificar todas as regiões genômicas homólogas, combinando os resultados de execuções de blastp únicas em cada gene, e classificando regiões genômicas de qualquer entrada genbank pelo número de acessos, conservação da sintenia e pontuação cumulativa de blast bit. As pesquisas de arquitetura podem ser realizadas para encontrar quaisquer regiões genômicas com hits de explosão a qualquer combinação especificada pelo usuário de seqüências de aminoácidos.


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