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Misturar Classificação e resumo
- Nome do editor:
- Isabelle Dupanloup
- Sistemas operacionais:
- Windows All
- Tamanho do arquivo:
- 62 KB
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Misturar Descrição
ADMIX é um aplicativo pequeno, simples e fácil de usar, projetado para ajudá-lo a calcular os estimadores a apenas alguns passos. Os arquivos de entrada podem ser: · 1ª linha: tempo em anos para o evento de mistura (se desta vez não for conhecido, é preciso escrever 0 em vez disso!) · 2ª linha: taxa de mutação por ano (se um tempo para o evento de mistura é dado na linha anterior, deve-se indicar uma taxa de mutação!) · 3ª linha: número de populações parentais · 4ª linha: número de loci · Seguindo linhas: para cada loci: · 1ª linha: nome do locus (esta linha deve conter pelo menos um caractere!) · 2ª linha: número de diferentes alelos (k) observados naquele locus · Próximos K linhas: Matriz triangular inferior especificando as distâncias moleculares entre alelos. No caso de sequências de DNA ou RFLPS, a distância molecular entre 2 alelos é apenas o número de substituições. Em caso de dados microssatélites, a distância molecular é a diferença quadrada no tamanho alelo (veja Bertorelle e exceloffier para mais detalhes). · Seguindo linhas: para cada loci: · 1ª linha: nome do locus (esta linha deve conter pelo menos um caractere!) · 2ª linha: tamanhos de amostra (número de cromossomos) nas populações misturadas e parentais naquele locus. O primeiro número refere-se à população misturada. Os seguintes números se referem às populações parentais. · Próximos Linhas K: Para cada locus, para cada população, o número de cópias observadas de cada alelo. Mais uma vez, o primeiro número refere-se à população misturada, e os seguintes números se referem às populações parentais.
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