MetaProt.

Pipeline para analisar regiões de codificação em projetos metagenômicos
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MetaProt. Classificação e resumo

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  • Rating:
  • Licença:
  • GPL
  • Nome do editor:
  • MR Orejuela
  • Sistemas operacionais:
  • Windows All
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  • 37 KB

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MetaProt. Descrição

O MetaProt foi desenvolvido como um pipeline de código aberto que fornece a possibilidade de analisar dados de proteínas de projetos metagenômicos, a fim de descrever a amostra com a quantidade máxima de dados disponíveis. Hoje em dia, há uma enorme quantidade de ferramentas realmente informativas para caracterizar os dados de sequenciamento, mas às vezes um não é suficiente e no final, muitos deles são usados de forma integrativa. Para simplificar e automatizar o processo, podemos usar scripts / programas de pipeline, como metaProt. O pipeline padrão foi implementado tendo em mente proteínas, mas se você deseja usar sequências nucleotídicas, sinta-se à vontade para baixar os bancos de dados que deseja usar.


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