A matriz de sequência é um aplicativo pequeno e fácil de usar, projetado para facilitar a montagem de matrizes de dados filogenéticos com vários genes. Arquivos para genes individuais são arrastados e descartados em uma janela e as seqüências são concatenadas. Uma tabela fornece uma visão geral sobre a quantidade de informação de sequência disponível para os diferentes genes e espécies. O usuário pode solicitar a matriz de sequência gerar uma grande variedade de conjuntos de caractere e taxon, por exemplo, um táxon definido com todas as espécies que têm mais do que um número especificado de genes ou bases de papel. As sequências concatenadas podem ser exportadas em formato Nexus ou TNT. Seqüências individuais podem ser excluídas de ser exportada.
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