Macaco um editor de plasmídeo pequeno e fácil de usar
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Macaco Descrição

APE foi desenvolvido para ser um editor de plasmídeo pequeno e fácil de usar. Principais características: destaca sites de restrição na janela de edição Reflete com precisão a represa / bloqueio de DCM de locais de enzima destaca o texto usando bibliotecas pré-definidas e personalizadas mostra tradução, tm,% gc, ORF de DNA selecionado em tempo real lê Strider DNA, FASTA, Genbank e arquivos EMBL salva arquivos como formato de arquivo compatível com ADN Strider ou Genbank Destaques e desenha mapas gráficos usando anotar anotações de arquivos Genbank e EMBL Explosão diretamente a sequência selecionada no NCBI ou no WormBase O mapa de texto mostra a seqüência de DNA, a tradução e as características como gráficos baseados em texto cria mapas de restrição gráfica - linear ou circular com recursos indicados Conecta recursos gráficos e de texto com hiperlink duplo clique salva gráficos como PostScript encapsulado ou gráficos vetoriais escaláveis Copiar e salvar gráficos como MetaFiles do Windows (somente do MS Windows) Restrição virtual digere Desenha escalas de DNA pré-definidas e definidas pelo usuário conecta bandas ao texto clique duas vezes Lê Abi Sequencing Trace Arquivos sequências em rastreamentos ABI podem ser alinhados diretamente a uma sequência de referência, com o alinhamento hiperlinked de volta ao Te Trace. Seleciona sites correspondentes a vários critérios (Union / Intersection - Freqüência de corte, tipo de site) em todas as janelas abertas seleciona sites que cortam mais frequentemente em uma sequência do que outra (para detecção de snip-snp ou digestas de diagnóstico) tem um agrupamento enzimático definido pelo usuário para distangue por exemplo. Enzimas atualmente em estoque. permite que os usuários definam novas enzimas por nome e site de reconhecimento Importa arquivos de formato de Strider de DNA (enzima simples, listas de sites) disponíveis no rebase A maioria das janelas de análise está hiperlink para suas seqüências correspondentes, incluindo: Mapas gráficas Mapas de texto digestas virtuais alinhamentos (incluindo seqüências abi) Sites silenciosos tradução Primer encontrar usa bibliotecas de definição de recursos personalizados, que permitem: ANOTAÇÃO RÁPIDA DA SEQUÊNCIA Pesquisa rápida e realce de todos os primers disponíveis que você (ou outros) tem que hibridizam para uma seqüência Sequência a ser anotada e visualizada de várias maneiras de forma rápida e eficiente Mapas gráficas que mostram sites de ligação ao primer e todos os recursos de seqüência interessante traduz seqüências com alinhamento opcional de DNA encontra potenciais iniciadores correspondentes critérios de usuário (comprimento, tm,% gc, auto / outros complementaridade) Alinhe duas seqüências de DNA (ou qualquer combinação de seqüência e rastreamento Abi), com o alinhamento hiperlink para a seqüência original encontra locais translacionalmente silenciosos desenha mapas de orf gráfico

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