Investigador de proteína.

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Investigador de proteína. Classificação e resumo

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Investigador de proteína. Descrição

Muitos exercícios de laboratório usam softwares de visualização molecular que permite que os alunos "vejam" uma proteína em sua forma tridimensional completa e façam hipóteses sobre as interações entre várias cadeias laterais. No entanto, esses programas não permitem que os alunos testem suas hipóteses porque o software de visualização molecular não permite que os alunos façam alterações na sequência de proteínas e observem seus efeitos na estrutura e função da proteína. O Protein Investigator é uma ferramenta muito útil projetada para fornecer aos usuários uma oportunidade para explorar interativamente a estrutura de proteínas e a função em um sistema simplificado. Este é um modelo altamente simplificado de dobragem de proteína. Não se destina a prever as estruturas corretas de quaisquer proteínas; Ele é projetado para ilustrar os principais princípios envolvidos nesse processo. Principais características: aminoácidos têm cadeias laterais de hidrofobicidade variável, carga e capacidade de ligação de hidrogênio. os aminoácidos um reconectado em uma cadeia não ramificada que pode dobrar. Os aminoácidos hidrofóbicos tendem a evitar a água que envolve a proteína; Os aminoácidos hidrofílicos se ligarão à água. aminoácidos que podem formar ligações de hidrogênio tendem a formar ligações de hidrogênio se puderem. Os aminoácidos positivamente carregados tenderão a formar ligações iônicas com aminoácidos carregados negativamente, se puderem. Os aminoácidos like-carga like se repelem se puderem. Interações iônicas são mais fortes que as ligações de hidrogênio, que são mais fortes que as interações hidrofóbicas. Proteínas podem ser dobradas sob oxidação (ligações dissulfureto) ou reduzindo as condições (desligamento de ligações dissulfureto).


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