Gs2.

Analise os estudos de associação do genoma com esta ferramenta.
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Gs2. Classificação e resumo

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  • Rating:
  • Licença:
  • Freeware
  • Nome do editor:
  • Fredrik Pettersson
  • Sistemas operacionais:
  • Windows All
  • Tamanho do arquivo:
  • 31.1 MB

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Gs2. Descrição

O GS2 é um aplicativo pequeno e simples especialmente projetado para ajudá-lo a analisar e visualizar todos os estudos de associação genômica. Com os recentes adiantamentos na eficiência da tecnologia de genotipagem de polimorfismo de nucleotídeos único de alta rendimento (SNP), os estudos de associação genômica são agora realizados rotineiramente com os tamanhos de amostra necessários para detectar os modestos efeitos genéticos que esperamos para doenças complexas. Principais características: fácil importação de conjuntos de dados de dados de genotipagem em larga escala. Atualmente, os formatos suportados são arquivos padrão de ped / dat, formato de cama e arquivos genótipos Hapmap. Realize o controle de qualidade com base nos limites especificados pelo usuário. Organizar conjuntos de dados na estrutura baseada em projetos Mantendo o controle do progresso de sua análise e crie subconjuntos separados de seus dados com base em Exemplos de estratificação, diferentes limites de controle de qualidade ou anotação biológica e recursos biológicos. Exportar subconjuntos de seus dados em diferentes formatos de dados a serem usados para executar análises externas adicionais ou compartilhar seus resultados e dados. Interprete seus dados em um contexto relevante, vinculando a anotação biológica, como o banco de dados genômica UCSC e informações em. Use as ontologias do gene para selecionar marcadores buscando palavras-chave em termos de anotação para função molecular, localização celular e processo biológico. Explore padrões de desequilíbrio de ligação usando funções construídas para cálculos e visualizações interativas. métodos integrados para calcular estatísticas básicas e realizar testes de associação. Salvar projetos inteiros em formato binário. Vantagens incluem envolvendo vários conjuntos de dados em um arquivo compacto que requer espaço menor no disco. Plot intensidades de genotipagem crua


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