Gepasi. Um sistema de software para a simulação de cinética química e bioquímica
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Gepasi. Classificação e resumo

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Gepasi. Descrição

O aplicativo GEPAsi foi desenvolvido para ser um sistema de software para a simulação de cinética química e bioquímica. Nesta seção conceitos básicos de modelos cinéticos (bio / químicos) são explicados. Você pode pular esta seção se estiver familiarizado com esse tipo de modelagem. A modelagem cinética é sobre descrever a evolução de um sistema no tempo. Um caso particular de modelagem cinética trata de encontrar um estado em que o sistema pára de evoluir no tempo. Tais estados são chamados estados estacionários. A cinética bio / química lida com a mudança de concentrações químicas com o tempo. A descrição matemática das alterações é feita por meio de equações diferenciais. Cada concentração de metabólito variável é então uma equação diferencial e é composta de contribuições positivas (de produção) e negativas (destruição). Essas equações são conhecidas como equações de equilíbrio, principalmente porque os dois termos equilibram em um estado estacionário. Os termos que compõem cada equação de equilíbrio sozinha também descrevem como as taxas de reação dependem das concentrações do metabólito. Isso significa que a mudança de uma concentração depende geral de todas as outras concentrações e é por isso que precisamos de softwares como Gepasi para produzir soluções numéricas dessas equações.

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