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Filódico Descrição

Patógenos vivem e se reproduzem dentro do hospedeiro humano, cujo sistema imunológico tentou continuamente livrar o corpo desses patógenos. Isso leva a um cabo de guerra entre o patógeno e o anfitrião humano, onde o patógeno tenta se adaptar de modo a "escapar" o sistema imunológico, enquanto o sistema imunológico aprende a reconhecer e eliminar novos patógenos estrangeiros. Um conjunto de players chave para o sistema imunológico são as proteínas HLA, cada uma das quais pode reconhecer fragmentos curtos específicos de proteínas estrangeiras (por exemplo, HIV), chamadas epitopos, em células infectadas e, em seguida, alerta o sistema imunológico à sua presença. Para evoluir patógenos em rápida, como o HIV, um mecanismo de defesa chave é evoluir mutações que impedem que as proteínas HLA reconhecem o DNA viral. Essa evolução ocorre de novo em cada paciente, já que cada paciente tem um conjunto diferente de proteínas HLA que reconhecem diferentes epítopos. O filod é uma ferramenta estatística que pode identificar mutações de HIV que derrotam a função das proteínas HLA em certos pacientes, permitindo assim que o vírus escape a eliminação pelo sistema imunológico. Ao aplicar esta ferramenta a grandes estudos de pacientes infectados, os pesquisadores agora são capazes de começar a decodificar as regras complexas que governam as mutações do HIV, na esperança de um dia criando uma vacina à qual o vírus é incapaz de desenvolver resistência. O aplicativo Phylod pré-compilado é uma parte do pacote Microsoft Computational Biology Tools. Requisitos: · Quadro líquido

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