Fastml. Um programa para calcular as sequências de aminoácidos ancestrais de uma árvore filogenética
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Fastml. Classificação e resumo

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Fastml. Descrição

Fastml foi desenvolvido para ser um programa para calcular as sequências de aminoácidos ancestrais de uma árvore filogenética. Uso: Fastml usa sinalizadores nos argumentos da linha de comando: -Para ajuda, digite "fastml.exe -h" -s seq.aln = o nome do arquivo de entrada de seqüência. -t tree.txt = O nome do arquivo de árvore de entrada (formato newick). O programa reconhece automaticamente qualquer um desses formatos de sequência: Phylip, Molphy, Fasta, Mase, Clustal ou Nexus. Use a opção -m para escolher um modelo. Os seguintes modelos são suportados (para aminoácidos): Dia, JTT, Rev, CPRev, WAG, JC. Para nucleótidos, atualmente apenas o modelo JC é suportado. O modelo padrão é o JTT.

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