FPG.simula uma população de tamanho constante | |
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FPG. Classificação e resumo
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- Freeware
- Nome do editor:
- Jody Hey
- Sistemas operacionais:
- Windows All
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FPG. Tag
- simulação simular simulador Cross constante. volume constante. sinal constante constante mutação populacional população exibir população população mundial População mundial para exibição contador de população Relógio populacional estimativa populacional verificador de população popups constantes valor constante Nome constante Lister. Listar nome constante. Nome constante Evolução da Genética da População Distribuição populacional Calculadora constante. genética populacional Simule o gargalo da população Gargalo Populacional taxa constante em montante simulador genético populacional Simulador de população Dinâmica populacional monitor populacional constante de inibição determinar constante. População autotetraplóide. simular aceleração constante mistura da população estimar parâmetros populacionais Tamanho da população eficaz estrutura genética populacional simule a população Simulação da população população demográfica. População genética definir grupos populacionais grupo populacional População Haplóide. Estratificação da população analisar a população Análise da população simulação população genética constante de dissociação
FPG. Descrição
O nome FPG representa a simulação genética da população para a frente. O FPG simula uma população de tamanho constante que está passando por vários processos evolutivos, incluindo: mutação, recombinação, seleção natural e migração. O significado de "encaminhar" neste contexto é simplesmente esse tempo, dentro da simulação, avança assim como no mundo real. Isso está em contraste com a simulação genética da população coalescente em que, como representada dentro da simulação, continua de volta para o passado. As simulações coalescentes têm muitas vantagens, mas são insuficientemente se incorporam a seleção natural em vários sites. O FPG é útil para avaliar o impacto da seleção natural em padrões de variação genética. Ele é projetado de modo a ser capaz de aproximar situações do mundo real com tamanhos populacionais bastante grandes e altas taxas de mutação durante longos períodos de DNA. O modelo de mutação é um modelo de sites infinitos, o que significa que nenhum site que é segregando na população pode receber outra mutação. A simulação acomoda mutações neutra, benéficas e deletérios em vários modelos de fitness diferentes, incluindo modelos de aptidão aditivos, multiplicativos e epistáticos. O programa gera uma ampla variedade de análises, incluindo níveis de polimorfismo, heterozigosidade (observada e esperada), taxas de fixação e desequilíbrio de ligação - todos conduzidos para cada uma das várias categorias de mutação. Quando a migração invocada, várias análises em relação à estrutura da população são realizadas. O ciclo de vida básico alterna entre genomas haplóide (gametas) e genomas diplóides (zigotos) e prossegue da seguinte forma: - Gametes são aleatoriamente emparelhados em zigotos - A aptidão é medida para cada zigoto como uma função das mutações que ela carrega. Se o domínio é definido para 0,5, o modelo é semelhante na maioria dos aspectos a um modelo de seleção Haplóide. - O sucesso reprodutivo é o número de gametas contribuiu para a próxima geração e é determinado para cada zigoto, desenhando de uma distribuição multinomial com expectativas que são os valores de aptidão relativos de cada classe de fitness. - Recombinação e mutação ocorrem durante a produção de gametas - Se houver várias populações, os gametas são desenhados aleatoriamente de cada população e colocados aleatoriamente em outras populações. Esses gametas que são deslocados por migrantes são perdidos, então a migração adiciona um elemento extra de deriva genética. Este é um modelo de migração da ilha - Novos zigotos são formados por união aleatória de gametas. Gerações são não sobrepostas.
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