O Pathway Editor é um aplicativo baseado em Java prático, fácil de usar, especialmente projetado para ajudá-lo a gerenciar, visualizar e editar a sinalização e as vias metabólicas. As vias podem ser criadas a partir do zero, acessadas abrindo um arquivo .path, ou baixado no site do Lipid Maps por meio do aplicativo Pathway Editor. Os gráficos do curso de tempo para lipídios e genes, e os dados para réplicas técnicas e biológicas para lipídios podem ser exibidos no Editor de via. Para lipídios, o Editor de Pathway também fornece links para KEGG e para registros de LMSD, com estruturas lipídicas e anotações. Links para anotações em Geneentrez e o banco de dados do genoma do rato são fornecidos para genes.
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