Clustal X. Este aplicativo apresenta um programa de alinhamento de seqüência de vários propósitos para DNA ou proteínas.
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Clustal X. Classificação e resumo

Clustal X. Tag

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Clustal X. Descrição

Clustal X é um programa avançado que lida com vários alinhamentos de seqüência para proteínas e DNA. Projetado como uma GUI para Clustalw, o programa realiza uma análise de sequência aprofundada, além de oferecer muitos utilitários para executar comparações adequadas. Carregar vários formatos especializados O programa é capaz de trabalhar com sequências prontas, importadas de arquivos dos seguintes formatos: EMBL / EMBL / Swissprot, NBRF / PIR, Pearson (FASTA), GCG / MSF (PileUp), Clustal (* .Aln), GCG9 / RSF e GDE. Durante o processo de importação, o Clustal X tenta detectar se as seqüências são nucleótidos ou aminoácidos, mas não há garantia real de que a escolha esteja correta. Destacando inteligentemente os elementos importantes O arquivo de origem foi carregado, o alinhamento de seqüência será exibido na janela principal do programa. O esquema de coloração integrado serve para destacar os recursos conservados, tornando-os aparecer através de cores vivas. A fim de distinguir o conteúdo das sequências, é recomendável que você use uma fonte maior; Isso resultará em uma visão de seqüência zoom, facilitando a sua composição. Processo de alinhamento fácil As operações permitidas pelo programa fazem bastante a lista; Você pode anexar uma sequência a um alinhamento existente, cortar ou colar um fragmento, bem como procurar uma string ou para remover as lacunas existentes. Além disso, você pode realizar alinhamentos por meio de um dos seguintes métodos: completar (a sequência passará por uma análise completa), somente a árvore de guia ou um realinhamento das seqüências selecionadas e / ou faixas de resíduos. Recomenda-se que antes de iniciar um processo de alinhamento, você redefine todos os parâmetros (novas lacunas, lacunas de proteína) para que os resultados sejam conclusivos. Analisar dados e obter um desenho de qualidade de alinhamento do mais importante indicativo da análise será o escore de qualidade de alinhamento, que é plotado para cada coluna individualmente. Uma pontuação alta designa uma coluna bem conservada, enquanto os baixos níveis de conservação são indicados por uma pontuação menor. Em conclusão, a análise depende de uma variedade de parâmetros, que devem ser definidos de acordo com o propósito científico que precisa ser realizado. Definitivamente, o programa faz uma ótima opção para os cientistas, bem como os alunos que estão procurando fazer uma operadora de sequenciamento de DNA. Avaliado por Andreea Matei, última atualização em 21 de julho de 2014

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