Bowtie para Linux.

Bowtie para Linux é um ultrafast, eficiente em memória de leitura de memória
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Bowtie para Linux. Classificação e resumo

Propaganda

  • Rating:
  • Licença:
  • Freeware
  • Nome do editor:
  • Ben Langmead
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  • Sistemas operacionais:
  • Linux
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  • 13.40MB

Bowtie para Linux. Tag


Bowtie para Linux. Descrição

Propaganda Bowtie for Linux é um software de casa e educação desenvolvido por Ben Langmead. Depois de nosso teste e teste, o software é provado ser oficial, seguro e livre. Aqui está a descrição oficial para Bowtie para Linux: Editar por Bowtie para Linux é um alinhador de leitura curta eficiente de memória e memória. Alinha seqüências de DNA curtas (leituras) ao genoma humano a uma taxa de 25 milhões de leituras por hora em uma estação de trabalho típica com 2 gigabytes de memória. Indices Bowtie O genoma com um índice Burrows-Wheeler para manter sua pegada de memória pequena: 1,3 GB para o genoma humano. Suporta políticas de alinhamento equivalentes a maq e sabão, mas é muito mais rápido: cerca de 35x mais rápido que o maq e mais de 350x mais rápido que sabão ao alinhar ao genoma humano. Recursos: Corrigido todos os problemas conhecidos com as opções --unfa / - UNFQ: Eles agora funcionam corretamente com vários tópicos. Corrigido problema em que a sequência e as quais foram às vezes invertidas. Corrigido outras questões que causam omissão espúria de leituras desalinhadas. Adicionado --maxfa / - Opções MaxFQ para que lês que não se alinham devido ao limite -m podem ser despejadas separadamente das leituras que não se alinham. A saída de alinhamento agora é garantida para ser "determinista" mesmo quando vários segmentos são usados. Ou seja, dadas as mesmas leituras de entrada (em qualquer ordem) e a mesma - Seed, Bowtie produzirá os mesmos alinhamentos toda vez que for executado, embora não necessariamente na mesma ordem. Isso não se abraça em diferentes versões do Bowtie. Várias outras correções de bugs.


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