BBrowser.

Berkeley Quantitative Genome Browser
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BBrowser. Classificação e resumo

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  • Rating:
  • Licença:
  • Freeware
  • Nome do editor:
  • Michael Eisen
  • Sistemas operacionais:
  • Windows All
  • Tamanho do arquivo:
  • 5.3 MB

BBrowser. Tag


BBrowser. Descrição

O nome BBrowser significa Berkeley Genome Browser Quantitative. O BQGB duplica grande parte da funcionalidade de exibição de anotação típica de um navegador genoma, mas com ênfase em dados personalizados e quantitativos, como os produzidos em estudos de sequenciamento de alta taxa de transferência e estudos de associação genômica. O aplicativo é executado localmente no desktop ou no laptop de um usuário, evitando o lento traseiro e os navegadores do genoma baseado na Web. O BQGB espera que os arquivos de dados sejam locais para o processo de aplicativo e em um formato de arquivo, como GFF, cama, SGR, WIG, FASTA ou qualquer formato delimitado de coluna que fornece localizações de posição de pares e pares de pares. Esta topografia deve ser geralmente mais rápida do que a de um banco de dados remoto central mais navegador baseado na Web ao trabalhar com muitos arquivos personalizados, ou seja. Baixando uma única anotação de referência para a máquina local é mais rápida do que fazer o upload de centenas de arquivos de dados personalizados para um servidor remoto! As necessidades de navegação são variadas e nenhuma ferramenta de visualização de ninguém deve fornecer uma visão sobre os fenômenos diversos da genética molecular, de SNPs altamente localizados, a elementos regulares e regulamentadores próximos e distantes, a distantes relações trans que podem até mesmo abrangentes espécies altamente divergentes. Além das visualizações embaladas com BQGB, o aplicativo fornece uma API de código aberto destinada a aliviar o trabalho de desenvolvimento on-indo que aborda as necessidades de visualização e exploração em evolução da investigação genética molecular.


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