Alinhamento estatístico rápido para Linux FSA é um algoritmo de alinhamento de seqüência múltipla probabilística.
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Alinhamento estatístico rápido para Linux Classificação e resumo

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Alinhamento estatístico rápido para Linux Descrição

Propaganda Alinhamento estatístico rápido para Linux é um software de casa e educação desenvolvido por Robert Bradley. Depois de nosso teste e teste, o software é provado ser oficial, seguro e livre. Aqui está a descrição oficial para o alinhamento estatístico rápido para o Linux: A FSA é um algoritmo de alinhamento de sequência múltipla probabilística que usa uma abordagem "à distância" "para alinhar seqüências de proteína, RNA ou DNA homólogas. Muito como métodos de reconstrução filogenética baseados em distância, como a junção de vizinhança, construir uma filogenia usando apenas estimativas de divergência de pares, a FSA constrói um alinhamento múltiplo usando apenas estimativas de homologia. Isso é possível pela técnica de recozimento de sequência para construir um alinhamento múltiplo de comparações em pares. O FSA traz as altas precisões anteriormente disponíveis apenas para análises de pequena escala de proteínas ou RNAs para problemas em larga escala, como alinhar milhares de seqüências ou sequências megabase longas. A FSA introduz vários métodos novos para construir melhores alinhamentos: A FSA usa técnicas de aprendizagem de máquina para estimar parâmetros de lacuna e substituição na mosca para cada conjunto de seqüências de entrada. Este método de alinhamento "consulta específico" torna o FSA muito robusto: pode produzir alinhamentos superiores de conjuntos de sequências homólogas que estão sujeitas a restrições evolutivas muito diferentes. A FSA é capaz de alinhar centenas ou até milhares de sequências usando um algoritmo de inferência randomizada para reduzir o custo computacional de vários alinhamentos. Esta inferência randomizada pode ter mais de dez vezes mais rápida que uma abordagem direta com pouca perda de precisão. A FSA pode alinhar rapidamente sequências muito longas usando a técnica "ancoragem de recozimento" para resolver as âncoras e projetá-las com ancoragem transitiva. Em seguida, costuma juntar o alinhamento entre as âncoras usando os métodos descritos acima. A GUI incluída, louca (múltipla exibição de alinhamento), pode exibir os alinhamentos intermediários produzidos pela FSA, onde cada personagem é colorido de acordo com a probabilidade de estar corretamente alinhada

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