Stream Uma estrutura para modelar a regulamentação transcricional usando modelos termodinâmicos estáticos
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Uma estrutura para modelar regulamento transcricional usando modelos termodinâmicos estáticos O nome do aplicativo Stream Java é uma abreviação do seguinte nome longo: modelo regulatório termodinâmico estático de transcrição. Em resumo, o fluxo é um pedido de bioinformática para pesquisadores, que querem modelar a regulamentação transcricional de um gene específico e prever sua produção transcricional em diferentes situações.stream é o primeiro quadro publicamente disponível para modelagem, visualização e previsão da regulamentação da transcrição Taxa de um gene alvo. A regulamentação transcricional de um gene em detalhes é um passo crucial para descobrir e, finalmente, utilizando a gramática regulatória do genoma. A modelagem de regulamentação transcricional utilizando equações termodinâmicas tornou-se uma abordagem cada vez mais importante para este objetivo. Embora a concentração de um conjunto de fatores de transcrição, bem como os locais de ligação do fator de transcrição em uma região de DNA regulamentar e a concentração do gene alvo, o fluxo otimizará Parâmetros para gerar um modelo que melhor se adapte aos dados de entrada. Este modelo treinado pode então ser usado para: · Validar que o conjunto fornecido de TFS é capaz de regular o gene alvo e · prever a taxa de transcrição sob diferentes condições (por exemplo, diferentes tecidos, nocaute / tfbs adicionais ou tfbs mutação). Requisitos: · Java.

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