SEQ-Gen.

SEQ-Gen - aplicação que simulará a evolução das sequências de nucleotídeos ou aminoácidos ao longo de uma filogenia
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SEQ-Gen. Classificação e resumo

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  • Nome do editor:
  • Andrew Rambaut
  • Site do editor:
  • http://tree.bio.ed.ac.uk/software/seal/
  • Sistemas operacionais:
  • Mac OS X
  • Tamanho do arquivo:
  • 2.9 MB

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SEQ-Gen. Descrição

SEQ-Gen - aplicação que simulará a evolução das sequências de nucleotídeos ou aminoácidos ao longo de uma filogenia A SEQ-Gen é uma aplicação que simulará a evolução das sequências de nucleotídeos ou aminoácidos ao longo de uma filogenia, utilizando modelos comuns do processo de substituição. Além disso, uma gama de modelos de evolução molecular será implementada, incluindo o modelo reversível geral. As freqüências de teste e outros parâmetros do modelo podem ser dadas e a taxa de taxa específica do local também pode ser incorporada de várias maneiras. Qualquer número de árvores pode ser lido e o programa produzirá qualquer número de conjuntos de dados para cada árvore. Assim, grandes conjuntos de simulações de replicadas podem ser facilmente criadas. Ele foi projetado para ser um simulador de uso geral que incorpora a maioria dos modelos comumente usados (e traciais computacionalmente) de evolução da sequência molecular.


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