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Aplicativo livre para adicionar hidrogens a um arquivo de estrutura molecular de banco de dados de proteína (PDB)
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  • Licença:
  • Freeware
  • Preço:
  • FREE
  • Nome do editor:
  • J. Michael Word
  • Site do editor:
  • http://kinemage.biochem.duke.edu/software/probe.php
  • Sistemas operacionais:
  • Mac OS X
  • Tamanho do arquivo:
  • 437 KB

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Reduzir Descrição

Aplicativo gratuito para adicionar hidrogens a um arquivo de estrutura molecular de banco de dados Proteína (PDB) Reduzir é um aplicativo gratuito para adicionar hidrogênios a um arquivo de estrutura molecular de banco de dados Proteína (PDB). Os hidrogênios são adicionados na geometria padronizada com otimização das orientações de OH, NH3, SH, ASN, conheceram metil e GLN Sidechain amides, e suas proteínas de anéis e ácidos nucleicos podem ser processados. Grupos HET também podem ser processados desde que a conectividade do Atom seja fornecida. Uma versão ligeiramente modificada da tabela de conectividade publicada pelo PDB está disponível abaixo. Note que o dicionário Het está disponível em dois "sabores" - novo e antigo. Qual deles usar é dependente de qual tipo de PDB reduzido você deseja como saída.


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