| Reduzir Aplicativo livre para adicionar hidrogens a um arquivo de estrutura molecular de banco de dados de proteína (PDB) |
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Reduzir Classificação e resumo
- Nome do editor:
- J. Michael Word
- Site do editor:
- http://kinemage.biochem.duke.edu/software/probe.php
- Sistemas operacionais:
- Mac OS X
- Tamanho do arquivo:
- 437 KB
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Aplicativo gratuito para adicionar hidrogens a um arquivo de estrutura molecular de banco de dados Proteína (PDB) Reduzir é um aplicativo gratuito para adicionar hidrogênios a um arquivo de estrutura molecular de banco de dados Proteína (PDB). Os hidrogênios são adicionados na geometria padronizada com otimização das orientações de OH, NH3, SH, ASN, conheceram metil e GLN Sidechain amides, e suas proteínas de anéis e ácidos nucleicos podem ser processados. Grupos HET também podem ser processados desde que a conectividade do Atom seja fornecida. Uma versão ligeiramente modificada da tabela de conectividade publicada pelo PDB está disponível abaixo. Note que o dicionário Het está disponível em dois "sabores" - novo e antigo. Qual deles usar é dependente de qual tipo de PDB reduzido você deseja como saída.
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