Alinhador de codoncode.

Um ótimo aplicativo para montagem de seqüência, edição de contig e detecção de mutação
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Alinhador de codoncode. Classificação e resumo

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  • Nome do editor:
  • CodonCode Corporation
  • Site do editor:
  • http://www.codoncode.com/index.htm
  • Sistemas operacionais:
  • Mac OS X 10.3.4 or later
  • Tamanho do arquivo:
  • 21.1 MB

Alinhador de codoncode. Tag


Alinhador de codoncode. Descrição

Um ótimo aplicativo para montagem de sequência, edição de contig e detecção de mutação O Alinhador de CodonCode é um programa para montagem de seqüência, edição de conteco e detecção de mutação, disponível para Windows e Mac OS X. Alinhador é compatível com phred-phrap e suporta totalmente as pontuações de qualidade de seqüência, oferecendo uma interface de usuário familiar e fácil de aprender O alinhador .CoDoncode permite aproveitar ao máximo os algoritmos modernos para o conjunto de chamadas e sequências básicas, sem forçar você a aprender opções de linha de comando complicadas ou programação Perl. Aqui estão algumas características principais do "Codoncode Aligner": · Importar seqüências de arquivos de texto. · Importar seqüências de arquivos ABI e SCF. · Grampo final. · Guarnição de vetor. · Monte os contigs. · Alinhar a uma seqüência de referência. · Alinhar contigs uns aos outros, mantendo os links para os traços. · Monte ou alinhe em grupos, com base em nomes de amostra. · Encontre mutações heterozigóticas. · Analisar inserções e exclusões heterozigóticas. · Definir regiões de interesse ("Recursos"), por exemplo, regiões de consenso de baixa qualidade. · Navegue rapidamente entre os recursos definidos pelo usuário. · Importar e editar conjuntos gerados pelo phrap. · Corra Phred e phrap diretamente de projetos de alinhador. · Você também tem a possibilidade de exportar recursos e seqüências. · Projetos de montagem compatíveis com a exportação. Limitações: · 30 dias período de teste. · Você pode usar em seus projetos apenas amostras sem cair. · Além disso, você não pode salvar, exportar ou imprimir a partir de projetos que contêm contigs, ou depois de experimentar qualquer uma das funções restritas (o alinhador irá avisá-lo primeiro). O que há de novo nesta versão: · Tradução de aminoácidos para todas as amostras. · Cores de fundo de tradução de proteína. · Mesas de diferença. · Importar diretamente do Genbank. · Menu Script. · Novos comandos de script. · Importar 454 dados (arquivos SFF). · Criar novas seqüências de texto. · Suportar projetos maiores. · Assembléias mais rápidas. · Uso de memória automática no Windows. · Apoio melhorado da caneta.


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