imol. imol - um aplicativo de visualização molecular livre para o sistema operacional Mac OS X.
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Imol - um aplicativo de visualização molecular livre para o sistema operacional Mac OS X. Imol é um aplicativo de visualização molecular livre para o sistema operacional Mac OS X. O programa é uma ferramenta indispensável para químicos e biólogos moleculares. Imol permite carregar moléculas usando vários formatos de arquivo: PDB, mol2, hin, carro, alc, bio. As moléculas podem ser salvas como PDB ou Bio Files. O arquivo Bio armazena todas as configurações de visualização e renderização (por exemplo, cores, iluminação, orientação de moléculas). Imol pode facilmente manipular moléculas pequenas e grandes, pode carregar várias moléculas, mover e girar de forma independente.imol é capaz de medir ângulos, ângulos de torção e distâncias entre os átomos. As moléculas podem ser sobrepostas e RMSD (desvio quadrado médio raiz) entre as coordenadas do Atom podem ser calculadas. As cadeias proteicas podem ser estruturalmente alinhadas para detectar regiões de alta similaridade estrutural. Imol pode carregar arquivos PDB multimodelo e exibi-los como uma dinamics trajetória.imol usa gráficos OpenGL para exibir moléculas. As moléculas podem ser renderizadas usando vários estilos: fios, pontos, van der waals esferas, bolas e varas, polígonos, fios, fita, desenhos animados, primavera, tubo, escada. Átomos individuais e / ou resíduos podem ser selecionados e prestados independentemente. Os estilos de renderização podem ser misturados para visualizar os sistemas moleculares complexos de uma maneira mais conveniente. Existem vários esquemas de cores predefinidos disponíveis (por exemplo, ordem de resíduo, estrutura secundária, hidrofobicidade), bem como cores personalizadas. Além disso, materiais diferentes (por exemplo, plástico, metal, vidro) podem ser usados. As imagens renderizadas podem ser exportadas como um bitmap, como um arquivo PostScript, ou como um arquivo de rádio POV.Efeitos de renderização versus estão disponíveis, incluindo rotação automática, borrão de movimento, sugestão de profundidade (neblina), gradiente de fundo, perspectiva e projeção estéreo (Usando métodos anaglyph de lado a lado e vermelho / azul). Vários parâmetros de renderização podem ser ajustados. Tuned.Requirements: · Processador G3400MHz ou melhor · 128 MB de RAM · OpenGL Accelerator · pelo menos 8 MB de RAM de vídeo. O que há de novo nesta versão: · Vários erros relacionados ao Intel-Transition corrigidos. · Bitmaps anti-alias de resolução arbitrária pode ser salvo. · Desenhos animados fixo e modo de renderização de fita sólida.

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