Visualizador de Gambit

Um visualizador de plataforma cruzada e bancada de análise para dados de sequenciamento de próxima geração
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Visualizador de Gambit Classificação e resumo

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  • Rating:
  • Licença:
  • GPL
  • Preço:
  • FREE
  • Nome do editor:
  • Derek Barnett
  • Site do editor:
  • http://code.google.com/u/DerekWBarnett/
  • Sistemas operacionais:
  • Mac OS X
  • Tamanho do arquivo:
  • 10.2 MB

Visualizador de Gambit Tag


Visualizador de Gambit Descrição

Um visualizador de plataforma cruzada e bancada de análise para dados de sequenciamento de próxima geração O aplicativo Gambit Viewer é um novo aplicativo GUI) Interface de Usuário (GUI) que visa ajudá-lo com a análise de seqüência. O software Gambit Viewer aproveita os recursos de indexação do formato de alinhamento de Bam Bam (justo) recentemente padronizado que permite o acesso rápido à Genomic dados, com tempo mínimo de inicialização e atraso de re-renderização. O Gambit Viewer também suporta uma variedade de formatos de anotação (cama, gff, gff3, vcf) "fora da caixa" para exibir anotações gênicas / região, bem como entradas SNP.O viewer Gambit é atualmente "plugin" Com relação ao suporte de formato, o suportamento de significado para novos formatos pode ser adicionado sem necessidade de modificar / atualizar o próprio programa principal.BioInformatics Análise de dados de sequência requer atualmente experiência especializada e está rapidamente se tornando um gargalo. As necessidades de análise de laboratórios de biologia menores podem ser servidas se o software de visualização integrar a funcionalidade analítica essencial. Essa funcionalidade inclui o design do primer PCR para suportar experimentos de validação do candidato SNP; Conectando-se a bancos de dados comuns; Exportando dados de regiões específicas do cromossomo para análise detalhada e focada.O Gambit Viewer logo será "concerado por plugin" com relação às ferramentas analíticas para fornecer funções integradas. Um benefício da implementação do sistema de análise via plugins é que qualquer pessoa com habilidades de programação pode prontamente incluir seus próprios recursos personalizados: Suporte para novos formatos de arquivo, métricas adicionais ou até mesmo visualizações personalizadas. Outro benefício é que os usuários não precisam adicionar todos os plugins. Você poderá personalizar o visualizador de gambit para ser tão leve ou totalmente funcional quanto suas necessidades necessárias. Requisitos: · Java.


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