| Triplexator. um kit de ferramentas computacional para a predição de hélices triplos de ácido nucleico |
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Triplexator. Classificação e resumo
- Nome do editor:
- Fabian A. Buske
- Site do editor:
- http://acb.qfab.org/acb/triplexator/
- Sistemas operacionais:
- Mac OS X
- Tamanho do arquivo:
- 514 KB
Triplexator. Tag
Triplexator. Descrição
O DNA de cadeia dupla é capaz de formar estruturas triplas-helicoidais, acomodando uma terceira vertente nucleotídeo em sua grande ranhura. Este processo específico de sequência oferece um mecanismo potente para direcionar loci de juros genômicos, que é de grande interesse para aplicações biodecnológicas e genéticas.Triplex-Formação requer um duplex, presumivelmente DNA, e uma sequência nucleotídica única encalhada que atua como A terceira fita, presumivelmente RNA.O processo de prever tríples putativos em dados de sequência pode ser dividido em três etapas: · Identificar os oligonucleótidos formadores de triplex (TFO) em seqüências de cadeia simples · identificar os locais-alvo triplex em seqüências de cadeia dupla Para acomodar uma terceira vertente · Avaliar a compatibilidade de pares de potenciais TFO / TTS de acordo com o Triplexador de regras de formação triplex canônico é uma aplicação que utiliza correspondência de padrões aproximados com base nas regras de formação triplex para encontrar pares de TFO-TTS putativos (triplas) em Dois conjuntos de sequências de nucleotídeos, onde um conjunto contém as seqüências duplex e as outras instruções thdetailed sobre como instalar e use o utilitário Triplexator no seu Mac está disponível aqui.
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