Topoografia

Um simulador neural de propósito geral com foco em mapas topográficos
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  • Nome do editor:
  • James A. Bednar
  • Site do editor:
  • http://topographica.org/Home/index.html
  • Sistemas operacionais:
  • Mac OS X 10.0 or later
  • Tamanho do arquivo:
  • 76 MB

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Topoografia Descrição

Um simulador neural de propósito geral com foco em mapas topográficos Topographica é um pacote de software para modelagem computacional de mapas neurais, desenvolvido pelo Grupo de Pesquisa Redes Neurais na Universidade do Texas em Austin e do Instituto de Adaptive e Neural Computation na Universidade de projeto Edinburgh.The é financiado pelo Projeto Cérebro Humano NIMH sob concessão 1R01-MH66991. O objetivo é pesquisadores ajudar a compreender o funcionamento do cérebro ao nível dos mapas topográficos que compõem systems.Topographica sensorial e motor se destina a complementar os muitos simuladores de bom nível baixo de neurônios que estão disponíveis, tais como Genesis e Neuron. Esses simuladores concentrar em modelar o comportamento interno detalhada dos neurônios e pequenas redes de them.Topographica se concentra sobre a estrutura em grande escala e função que é visível apenas quando muitos milhares de tais neurônios são conectados em mapas topográficos contendo milhões de conexões. Muitos fenômenos importantes não podem ser estudados sem essas grandes redes, incluindo a organização bidimensional de mapas de orientação e direção de movimento visuais e segmentação de objetos e agrupamento processes.To fazer tais modelos práticos, em Topographica a unidade fundamental é uma folha de neurônios, em vez que um neurônio ou uma parte de um neurônio. Para a maioria das simulações, as folhas podem ser implementadas em um alto nível, composto por taxa de disparo abstrato ou integrar-e-fogo neurônios. Quando necessário para a validação ou de fenômenos específicos, Topographica pode facilmente ser estendido usando uma folha que interfaces para mais detalhados modelos de neurônios em outros simuladores. folhas menos detalhados também pode ser usado temporariamente, por exemplo ao interagir com o modelo em tempo real. Topographica faz com que seja simples de utilizar um nível apropriado de complexidade e detalhe, tal como determinado pela potência de computação disponível, quantidade de dados biológicos disponíveis para validação e fenómenos de interesse. O que há de novo nesta versão: Melhorias gerais: · Melhorias significativas de desempenho em simulações (quase 2X gerais), plotagem (2X) e tempo de inicialização · Pequenas correções de bugs · Mais opções para adicionar o ruído de formas ConnectionField · Opcional linha por linha profiling · Pacote Cython opcional para escrever componentes rápidos Command-line e batch: · -V e opções -d para imprimir detalhado e mensagens de depuração · Novas opções para run_batch e melhores mensagens de progresso · Substituído a maioria dos comandos com ParameterizedFunctions, que documentaram, tipo e argumentos vinculados-verificados e permitir herança de funcionalidade compartilhada · Comandos de medição mapa substituídos em topo.command com mais simples, de uso geral, facilmente .ty-arquivo versões controláveis (veja lissom_oo_or.ty e lissom.ty para exemplos) · Save_plotgroup: valores padrão mais úteis; resultados podem ser armazenados em cache para evitar recomputation · Measure_sine_pref: medição de uso geral para qualquer preferência que pode ser testada com uma grelha sinusoidal · Mudou locals aos parâmetros de nível de script usando GlobalParams; ver exemplos / lissom.ty · Gradientplot Feito e fftplot disponível no modo batch. GUI: · Editor modelo suporta EventProcessors não-patrimonial e EPConnections não CFProjection · Clique com o botão direito de opção para traçar as curvas de ajuste · Janelas da trama podem ser dispostos em 2D, e não apenas uma linha (ver Sheet.row_precedence) Scripts de exemplo: · Exemplo arquivo para interface com simuladores externos (exemplos / perrinet_retina.ty) · Removido ultrapassada ou em andamento exemplos · Grandemente simplificadas exemplos de scripts restantes · Agora usar GlobalParams para apoiar configuração de opção consistente usando -p · Permitido poupança de funções locais e chamadas de método instância em snapshots biblioteca de componentes: · PatternGenerators: Tradutor; parâmetro mask_shape agora também torna mais fácil para especificar uma máscara para qualquer padrão, por exemplo, na GUI · TransferFns (anteriormente chamado OutputFns): HalfRectifyAndPower, histerese e HomeostaticResponse · Folhas: ActivityCopy · LearningFns: CFPLF_BCMFixed_opt, CFPLF_Scaled_opt · Parâmetros Adicionado HookList para FeatureResponses e ágil para tornar mais fácil para adicionar funcionalidade definida pelo usuário. · Mudou de nome e definições de vários conceitos semelhantes (OutputFn, before_presentation, update_command, plot_command, etc.) para refletir conceito compartilhado de ganchos e HookLists (listas de chamáveis para executar em pontos específicos no código). · Parâmetros: limites podem agora ser exclusiva apoio, opcional para Nenhum na maioria dos tipos


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