| Spdbv. UI projetado para analisar várias proteínas ao mesmo tempo |
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Spdbv. Classificação e resumo
- Nome do editor:
- GlaxoSmithKline R&D
- Site do editor:
- http://spdbv.niehs.nih.gov/
- Sistemas operacionais:
- Mac OS X
- Tamanho do arquivo:
- 13.2 MB
Spdbv. Tag
Spdbv. Descrição
Ui projetado para analisar várias proteínas ao mesmo tempo Swiss-PDBViewer (SPDBV), AKA DeepView, é um aplicativo que fornece uma interface amigável que permite analisar várias proteínas ao mesmo tempo. As proteínas podem ser sobrepostas para deduzir alinhamentos estruturais e comparar seus sites ativos ou quaisquer outras partes relevantes. Mutações de aminoácidos, títulos H, ângulos e distâncias entre os átomos são fáceis de obter graças à interface gráfica e menu intuitiva.Moreover, a Swiss-PDBViewer está firmemente ligada ao modelo suíço, um servidor de modelagem de homologia automatizado desenvolvido no Instituto Suíço de Bioinformatics (SIB) em colaboração entre GlaxoSmithKLine Rd e o grupo de bioinformática estrutural no Biozentrum em Basileia. O trabalho com estes dois programas reduz muito a quantidade de trabalho necessária para gerar modelos, pois é possível encadear uma sequência primária de proteína em um modelo 3D e obter um feedback imediato de quão bem a proteína roscada será aceita pela estrutura de referência antes de enviar uma solicitação para construir loops ausentes e refinar o Packing Sidechain.swiss-PDBViewer também é capaz de ler os mapas de densidade eletrônica e oferece várias ferramentas para a densidade. Além disso, várias ferramentas de modelagem são incluídas e arquivos de comando para pacotes de minimização de energia popular podem ser gerados. O que há de novo nesta versão: · O átomo de timina C6 está agora corretamente carregado. · Corrigido o loop infinito de saída de raios POV na versão do PC. · O acidente ocasional enquanto economiza arquivos PDB (como 2i37) no PC foi corrigido. · Atualizou o endereço do servidor de mapa de densidade de elétrons uppsala.
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