Samambaia Um quadro Java para simulação estocástica e avaliação de redes de reação
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Um quadro Java para simulação estocástica e avaliação de redes de reação A Samambaia (estrutura para avaliação de redes de reação) é uma estrutura livre e aberta, extensível e abrangente para simulações e análises eficientes de redes de reação química escrita em Java. A Samambaia inclui algoritmos de última geração para simulação estocástica e um poderoso sistema de visualização baseado no GnuPlot e no cytoscape. Embora a samambaia consiste em mais de 100 classes e interfaces, a maioria das classes é basicamente apenas implementações de uma das três principais interfaces e classes abstratas. · O A rede de interface fornece a estrutura de rede do modelo. · O simulador de classe abstrata executa simulações em uma rede. Ele também chama os observadores registrados durante a execução de simulação. · O observador de classe abstrata traça o progresso da simulação e cria a saída de simulação. Algumas informações adicionais sobre como usar a Ferramba estará disponível aqui. Requisitos: · Java.

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