| Rnashapes. ferramenta de análise de RNA de linha de comando livre |
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Rnashapes. Classificação e resumo
- Nome do editor:
- RNAshapes Team
- Site do editor:
- http://bibiserv.techfak.uni-bielefeld.de/rnashapes/
- Sistemas operacionais:
- Mac OS X
- Tamanho do arquivo:
- 1.4 MB
Rnashapes. Tag
Rnashapes. Descrição
Ferramenta de análise de RNA de linha de comando gratuita A abstração de forma de RNA mapeia estruturas para um domínio da árvore de formas, retenção de adjacência e aninhamento de características estruturais, mas desconsiderando os comprimentos de hélice. A abstração de forma integra bem os algoritmos de programação dinâmica e, portanto, pode ser aplicado durante a previsão da estrutura, em vez de depois. Isso evita a explosão exponencial e ainda pode nos dar uma conta não-heurística e completa de propriedades do espaço de dobramento da molécula.Rnashapes oferece três poderosas ferramentas de análise de RNA em um único pacote de software: · Computação de um pequeno conjunto de estruturas representativas de diferentes formas, Completo em um sentido bem definido. · Computação de probabilidades de forma acumulada. · Previsão comparativa de estruturas de consenso, como alternativa ao mais caro algoritmo Sankoff, está disponível como C código fonte e binários compilados e pode ser usado no Mac Máquinas baseadas no OS X, UNIX e Microsoft.
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