Pycogent. kit de ferramentas de sequência de python livre e aberto
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Pycogent. Classificação e resumo

Pycogent. Tag

conjunto de ferramentas Python Toolkit Kit de ferramentas de seqüência Sequência Python. seqüência Pycogent.

Pycogent. Descrição

Kit de ferramentas de sequência de código livre livre e aberto O pycogent é um kit de ferramentas para fazer sentido da sequência. O pycogent inclui conectores a bancos de dados remotos, controladores para aplicações de terceiros e técnicas probabilísticas generalizadas internas para trabalhar com sequências biológicas. Requisitos: · Python 2.5.1 ou posterior · NUMPY 1.0 ou posterior O que há de novo nesta versão: · A instalação do Pypi agora funciona, consulte Trabalhos em Bug 2807542, 2807539 Cogent 1.2 - 1.3 Novos Recursos · Python2.6 agora é suportado · Adicionado Cogent.cluster.nmds, código para executar o dimensionamento multidimensional nãométrico. Não tão rápido quanto os outros (por exemplo, r, pacote de massa, isomds) · Documentação portado para usar o gerador de documentação Esfinge. · Major Adições à Documentação em Doc / Exemplos. · Adicionado suporte parcial para consultar os bancos de dados do Ensembl MySQL. Esta capacidade tem dependências adicionais (mysql-python e sqlalchemy). Este módulo deve ser considerado código de nível alfa, (embora tenha funcionado de forma confiável por algum tempo nas mãos dos desenvolvedores). · Introduziu uma nova família de modelo de substituição. Esta família tem a mesma forma que originalmente descrita por Musa e Gaut.

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