Puma uma ferramenta para a análise bayesiana da adequação do modelo particionado
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Puma Classificação e resumo

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analisar análise Bayesian. Análise Bayesiana

Puma Descrição

A PUMA é uma aplicação baseada em Java avaliando a adequação dos modelos filogenéticos de evolução da sequência em um contexto bayesiano usando uma simulação preditiva posterior. A precisão da inferência filogenética bayesiana utilizando dados moleculares demonstrou depender do uso de modelos adequados de evolução da sequência. Ao escolher o melhor modelo disponível a partir de um conjunto de alternativas tornou-se prática padrão em filogenética estatística, a avaliação da adequação do modelo escolhido é rara. Programas para inferência filogenética bayesiana começaram recentemente a implementar modelos de evolução da sequência que representam a heterogeneidade no processo entre os sites, ainda não existe nenhum programa para avaliar a adequação desses modelos. A Puma implementa uma abordagem de simulação preditiva posterior para avaliar a adequação de modelos particionados, sem vontade e mistura de evolução da sequência de DNA em um contexto bayesiano. A avaliação da adequação do modelo permite que os filogenetistas empíricos tenham confiança apropriada em seus resultados e guia os esforços dos filogenetistas teóricos na melhoria dos modelos de evolução da seqüência.

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