Pls e análise de NPairs os pls (mínimos quadrados parcelos) e NPairs (não paramétricos, previsões, ativação, influência, reprodutibilidade, re-amostragem) O pacote de software de neuroimagem desenvolvido no Rotman Research Institute
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Os pls (mínimos quadrados parcelos) e NPairs (não paramétricos, previsões, ativação, influência, reprodutibilidade, re-amostragem) Neuroimagem pacote de software desenvolvido no Rotman Research Institute A análise Pls e NPairs é um conjunto de ferramentas que podem ser usadas em fins científicos. Os mínimos quadrados parciais (PLS) foram introduzidos pela primeira vez à comunidade de neuroimagem em 1996 (McIntosh et al., 1996), para medir respostas de tarefas distribuídas (pls de centragem média e pls de tarefa não rotacionados). Pls também foi aplicado a medir padrões distribuídos que impactam no desempenho da tarefa (pls regulares de comportamento, sem saída de comportamento e pls multiblock) e, finalmente, para a conectividade regional do estado dependente da tarefa e de descanso (McIntosh e Lobaugh, 2004). Os nPairs (Não paramétrico, previsão, ativação, influência, reprodutibilidade, re-amostragem) O pacote foi introduzido pela primeira vez com a análise de variadores canônicos (ou seja, análise discriminante linear) e uma métrica de reprodução (Strother et al., 1997) seguida pela adição de métricas de previsão ( Suporte et al., 2002). Os NPairs usam uma base PCA penalizada (Denoising PCA) adaptada para otimizar as métricas de reprodutibilidade e previsão para o CVA. Além de medir a tarefa distribuída e as respostas do estado de descanso, os NPairs fornecem uma estrutura de reamplagem estatística com blocos de construção básicos para as escolhas de pré-processamento e pré-processamento e dados, (isto é, processamento de pipeline) (Suporte et al., 2004) .both pls e nPairs / A CVA provou ser métodos robustos para extrair mudanças de sinal distribuídas relacionadas à mudança de demandas de tarefas em neuroimagem. Suas forças relativas e fraquezas estão sendo avaliadas no Instituto de Pesquisa do Rotman. Requisitos: · Java 1.6 ou mais tarde O que há de novo nesta versão: · NPairs Group Particionando Bug Corrigido: Agora funciona mesmo no caso de que o particionamento de grupo proporcional leva a números fracionários de objetos em uma partição, e. Se houver 2 grupos de 5 para serem particionados em metades divididas (portanto, uma simples divisão proporcional levaria a 2.5 membros de cada grupo em cada meio dividida), agora um grupo é escolhido aleatoriamente para ser aumentado (a 3) e o outro decrementados (para 2) e vice-versa para a outra meia dividida. · NPairs GUI aprimorou para ser compatível com mais ambientes: o campo 'Etapa' da faixa de PC deve agora ser visível no Mac OS X e no Ubuntu. · PLS BOOTSTRAP BOOTSTRAP PLS (erro de indexação off-by-one) corrigido. · Opção adicionada aos NPairs para usar 'Executar' em vez de 'sessão' como 'objeto dividido' (i.E. Dividir a unidade) ao reamplar os dados. Há um novo menu suspenso na janela Configuração de Análise, permitindo que o usuário especifique o objeto Split (o padrão ainda é 'sessão'). Esse recurso foi adicionado à GUI, mas ainda não está incluído nas ferramentas PLSnPairs da linha de comando (em lote). · NPairs: NPEARS: O número de cova da CVA dentro da classe W agora está sempre verificado e o aviso é impresso para o arquivo de log de análise se cond (W)> 1000. (condição não. É a proporção de maior para o menor para o eigenvalue da decomposição espectral de W; quanto maior a condição não., O mais próximo é a singularidade.) · NPairs CVA CVA CVA Convergence Convergence Projection: Agora, se o cálculo do CDF não falhar em convergir para valores de entrada que forem muito altos (e acima do valor crítico para o limite de valor p padrão de 0,95), o valor p do chi-quadrado correspondente é salvo arquivos de saída como 1.0. · Valores de NPairs CVA R2 salvos em resultados .mat arquivo como: npairs_result.r2_full_data (no. Pc dims linhas x no. Cv dims cols) e mlcell npaairs_result.r2_splits: uma célula / cv dim e cada célula contendo (não. Divide) linhas X (não. Pc dims) cols. Também salvo como textos com sufixo '.r2'. Os valores R2 são calculados entre os escores canônicos CVA para cada Dimagem Dimagem CV e Dados de Entrada (por exemplo, PCA Dims) para determinar a bondade de ajuste entre cada dimensão do CV e dimensão (PCA) dims. · RESULTADOS PLS bloqueados salvos com suffix _bfmriresult.mat para corresponder à sintaxe de saída Matlab Pls. Agora, o visualizador de resultados reconhecerá quais arquivos de sessão e datamats correspondem a uma determinada análise de pls bloqueadas. · Centralizado médio (tarefa) PLS Permutação Bug Corrigido: Agora, os dados resultam, dando valores de permutação (singular) maiores que os observados devem estar corretos.

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